राष्ट्रीय राजधानी क्षेत्र परिवहन निगम की सतर्कता यूनिट राष्ट्रीय राजधानी क्षेत्र परिवहन निगम के सभी सतर्कता मामलों के लिए नोडल एजेंसी है। मुख्य सतर्कता अधिकारी इस यूनिट के प्रधान हैं। एक पूर्णकालिक उप-मुख्य सतर्कता अधिकारी, दो वरिष्ठ सतर्कता अधिकारियों, तीन सहायक सतर्कता अधिकारी और चार सतर्कता निरीक्षकों द्वारा मुख्य सतर्कता अधिकारी की सहायता की जाती है।
सतर्कता यूनिट शहरी विकास मंत्रालय के सतर्कता यूनिट और केन्द्रीय सतर्कता आयोग के घनिष्ठ समन्वय में कार्य करता है। राष्ट्रीय राजधानी क्षेत्र परिवहन निगम में सतर्कता का कार्य निवारक जांच करना, विभिन्न स्रोतों से प्राप्त शिकायतों की तहकीकात करना और सीटीई द्वारा उनकी सघन जांचों में उठाए गए पैरा की विस्तार से तहकीकात करना होता है।
जहां कहीं राष्ट्रीय राजधानी क्षेत्र परिवहन निगम के प्रशासनिक कार्यकरण में सुधार किया जाना आवश्यक हो, सतर्कता यूनिट प्रणालीगत सुधार हेतु भी सुझाव देता है। राष्ट्रीय राजधानी क्षेत्र परिवहन निगम का सतर्कता एकक समय-समय पर सतर्कता जागरूकता कार्यक्रम की व्यवस्था करता है। ये कार्यक्रम सभी संबंधित व्यक्तियों के लाभार्थ आयोजित किए जाते हैं। ऐसे कार्यक्रमों के दौरान, संगठन में सतर्कता जागरूकता पैदा करने के लिए सभी अधिकारियों/कर्मचारियों को आमंत्रित किया जाता है।